Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
EBF2Q9HAK2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EBF2Q9HAK2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EBF2Q9HAK2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms