Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLR1BQ9H9Y6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR1BQ9H9Y6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR1BQ9H9Y6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1BQ9H9Y6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms