Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W5

TRIM45, Tripartite motif-containing protein 45, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM45Q9H8W5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM45Q9H8W5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM45Q9H8W5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM45Q9H8W5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM45Q9H8W5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM45Q9H8W5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM45Q9H8W5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM45Q9H8W5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM45Q9H8W5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM45Q9H8W5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM45Q9H8W5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms