Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SUDS3Q9H7L9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SUDS3Q9H7L9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SUDS3Q9H7L9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SUDS3Q9H7L9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SUDS3Q9H7L9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SUDS3Q9H7L9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUDS3Q9H7L9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUDS3Q9H7L9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUDS3Q9H7L9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUDS3Q9H7L9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUDS3Q9H7L9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUDS3Q9H7L9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SUDS3Q9H7L9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUDS3Q9H7L9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUDS3Q9H7L9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUDS3Q9H7L9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUDS3Q9H7L9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUDS3Q9H7L9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUDS3Q9H7L9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SUDS3Q9H7L9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUDS3Q9H7L9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUDS3Q9H7L9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUDS3Q9H7L9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUDS3Q9H7L9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUDS3Q9H7L9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUDS3Q9H7L9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUDS3Q9H7L9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUDS3Q9H7L9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUDS3Q9H7L9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms