Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPAP3Q9H6T3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPAP3Q9H6T3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPAP3Q9H6T3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RPAP3Q9H6T3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPAP3Q9H6T3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPAP3Q9H6T3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPAP3Q9H6T3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP3Q9H6T3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP3Q9H6T3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP3Q9H6T3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAP3Q9H6T3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAP3Q9H6T3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAP3Q9H6T3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAP3Q9H6T3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAP3Q9H6T3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAP3Q9H6T3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAP3Q9H6T3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPAP3Q9H6T3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPAP3Q9H6T3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPAP3Q9H6T3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPAP3Q9H6T3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPAP3Q9H6T3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAP3Q9H6T3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAP3Q9H6T3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAP3Q9H6T3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAP3Q9H6T3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAP3Q9H6T3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAP3Q9H6T3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RPAP3Q9H6T3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPAP3Q9H6T3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPAP3Q9H6T3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPAP3Q9H6T3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPAP3Q9H6T3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPAP3Q9H6T3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RPAP3Q9H6T3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RPAP3Q9H6T3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP3Q9H6T3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms