Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACSS3Q9H6R3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSS3Q9H6R3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACSS3Q9H6R3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACSS3Q9H6R3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACSS3Q9H6R3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACSS3Q9H6R3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ACSS3Q9H6R3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ACSS3Q9H6R3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACSS3Q9H6R3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACSS3Q9H6R3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACSS3Q9H6R3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSS3Q9H6R3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSS3Q9H6R3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSS3Q9H6R3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACSS3Q9H6R3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACSS3Q9H6R3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSS3Q9H6R3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSS3Q9H6R3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSS3Q9H6R3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSS3Q9H6R3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSS3Q9H6R3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACSS3Q9H6R3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSS3Q9H6R3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSS3Q9H6R3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms