Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I2

ZHX3, Zinc fingers and homeoboxes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZHX3Q9H4I2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ZHX3Q9H4I2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZHX3Q9H4I2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZHX3Q9H4I2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZHX3Q9H4I2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZHX3Q9H4I2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZHX3Q9H4I2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZHX3Q9H4I2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZHX3Q9H4I2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ZHX3Q9H4I2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZHX3Q9H4I2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZHX3Q9H4I2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZHX3Q9H4I2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZHX3Q9H4I2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZHX3Q9H4I2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZHX3Q9H4I2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZHX3Q9H4I2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZHX3Q9H4I2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZHX3Q9H4I2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZHX3Q9H4I2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZHX3Q9H4I2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ZHX3Q9H4I2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ZHX3Q9H4I2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZHX3Q9H4I2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZHX3Q9H4I2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZHX3Q9H4I2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZHX3Q9H4I2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZHX3Q9H4I2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZHX3Q9H4I2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZHX3Q9H4I2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZHX3Q9H4I2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZHX3Q9H4I2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZHX3Q9H4I2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZHX3Q9H4I2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZHX3Q9H4I2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZHX3Q9H4I2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZHX3Q9H4I2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 374.7 ms