Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00597Q9H2U6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC00597Q9H2U6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINC00597Q9H2U6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINC00597Q9H2U6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms