Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA6AQ9H2E6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA6AQ9H2E6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA6AQ9H2E6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms