Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1X1

RSPH9, Radial spoke head protein 9 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH9Q9H1X1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RSPH9Q9H1X1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RSPH9Q9H1X1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RSPH9Q9H1X1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RSPH9Q9H1X1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms