Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLIRPQ9GZT3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLIRPQ9GZT3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLIRPQ9GZT3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLIRPQ9GZT3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms