Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR1EQ9GZS1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR1EQ9GZS1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1EQ9GZS1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1EQ9GZS1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1EQ9GZS1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1EQ9GZS1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1EQ9GZS1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1EQ9GZS1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1EQ9GZS1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1EQ9GZS1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1EQ9GZS1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1EQ9GZS1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1EQ9GZS1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1EQ9GZS1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1EQ9GZS1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1EQ9GZS1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR1EQ9GZS1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR1EQ9GZS1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR1EQ9GZS1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1EQ9GZS1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1EQ9GZS1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR1EQ9GZS1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR1EQ9GZS1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR1EQ9GZS1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR1EQ9GZS1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR1EQ9GZS1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR1EQ9GZS1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR1EQ9GZS1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR1EQ9GZS1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR1EQ9GZS1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR1EQ9GZS1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR1EQ9GZS1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1EQ9GZS1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1EQ9GZS1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
POLR1EQ9GZS1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR1EQ9GZS1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR1EQ9GZS1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR1EQ9GZS1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms