Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Dkc1Q9ESX5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dkc1Q9ESX5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dkc1Q9ESX5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dkc1Q9ESX5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dkc1Q9ESX5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dkc1Q9ESX5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dkc1Q9ESX5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dkc1Q9ESX5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dkc1Q9ESX5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dkc1Q9ESX5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dkc1Q9ESX5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dkc1Q9ESX5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Dkc1Q9ESX5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Dkc1Q9ESX5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dkc1Q9ESX5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Dkc1Q9ESX5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dkc1Q9ESX5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dkc1Q9ESX5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dkc1Q9ESX5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dkc1Q9ESX5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dkc1Q9ESX5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dkc1Q9ESX5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms