Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
Brd4Q9ESU6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
Brd4Q9ESU6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
Brd4Q9ESU6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Brd4Q9ESU6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Brd4Q9ESU6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Brd4Q9ESU6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Brd4Q9ESU6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Brd4Q9ESU6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Brd4Q9ESU6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Brd4Q9ESU6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Brd4Q9ESU6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Brd4Q9ESU6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Brd4Q9ESU6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Brd4Q9ESU6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Brd4Q9ESU6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
Brd4Q9ESU6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
Brd4Q9ESU6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Brd4Q9ESU6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
Brd4Q9ESU6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Brd4Q9ESU6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Brd4Q9ESU6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Brd4Q9ESU6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Brd4Q9ESU6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
Brd4Q9ESU6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Brd4Q9ESU6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Brd4Q9ESU6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Brd4Q9ESU6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
Brd4Q9ESU6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Brd4Q9ESU6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Brd4Q9ESU6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Brd4Q9ESU6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Brd4Q9ESU6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
Brd4Q9ESU6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
Brd4Q9ESU6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Brd4Q9ESU6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
Brd4Q9ESU6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Brd4Q9ESU6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Brd4Q9ESU6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Brd4Q9ESU6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Brd4Q9ESU6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Brd4Q9ESU6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Brd4Q9ESU6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Brd4Q9ESU6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Brd4Q9ESU6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Brd4Q9ESU6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Brd4Q9ESU6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Brd4Q9ESU6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Brd4Q9ESU6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Brd4Q9ESU6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Brd4Q9ESU6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Brd4Q9ESU6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Brd4Q9ESU6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Brd4Q9ESU6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Brd4Q9ESU6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Brd4Q9ESU6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Brd4Q9ESU6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Brd4Q9ESU6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Brd4Q9ESU6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Brd4Q9ESU6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Brd4Q9ESU6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Brd4Q9ESU6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Brd4Q9ESU6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Brd4Q9ESU6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Brd4Q9ESU6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Brd4Q9ESU6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Brd4Q9ESU6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Brd4Q9ESU6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Brd4Q9ESU6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Brd4Q9ESU6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Brd4Q9ESU6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Brd4Q9ESU6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Brd4Q9ESU6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Brd4Q9ESU6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Brd4Q9ESU6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Brd4Q9ESU6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Brd4Q9ESU6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Brd4Q9ESU6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Brd4Q9ESU6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Brd4Q9ESU6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Brd4Q9ESU6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Brd4Q9ESU6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Brd4Q9ESU6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Brd4Q9ESU6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Brd4Q9ESU6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Brd4Q9ESU6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
Brd4Q9ESU6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Brd4Q9ESU6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Brd4Q9ESU6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Brd4Q9ESU6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
Brd4Q9ESU6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Brd4Q9ESU6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
Brd4Q9ESU6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Brd4Q9ESU6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Brd4Q9ESU6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Brd4Q9ESU6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Brd4Q9ESU6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Brd4Q9ESU6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Brd4Q9ESU6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Brd4Q9ESU6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms