Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenofQ9ERR7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenofQ9ERR7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenofQ9ERR7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SelenofQ9ERR7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SelenofQ9ERR7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SelenofQ9ERR7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SelenofQ9ERR7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms