Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERQ3

Znf704, Zinc finger protein 704, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf704Q9ERQ3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf704Q9ERQ3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf704Q9ERQ3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf704Q9ERQ3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf704Q9ERQ3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf704Q9ERQ3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf704Q9ERQ3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf704Q9ERQ3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf704Q9ERQ3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf704Q9ERQ3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf704Q9ERQ3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf704Q9ERQ3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf704Q9ERQ3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf704Q9ERQ3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf704Q9ERQ3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf704Q9ERQ3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf704Q9ERQ3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf704Q9ERQ3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf704Q9ERQ3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf704Q9ERQ3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf704Q9ERQ3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf704Q9ERQ3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf704Q9ERQ3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf704Q9ERQ3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf704Q9ERQ3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Znf704Q9ERQ3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Znf704Q9ERQ3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf704Q9ERQ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf704Q9ERQ3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf704Q9ERQ3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf704Q9ERQ3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf704Q9ERQ3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf704Q9ERQ3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf704Q9ERQ3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf704Q9ERQ3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf704Q9ERQ3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf704Q9ERQ3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf704Q9ERQ3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znf704Q9ERQ3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf704Q9ERQ3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf704Q9ERQ3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf704Q9ERQ3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf704Q9ERQ3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf704Q9ERQ3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf704Q9ERQ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Znf704Q9ERQ3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf704Q9ERQ3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf704Q9ERQ3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf704Q9ERQ3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf704Q9ERQ3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf704Q9ERQ3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms