Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc28a3Q9ERH8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc28a3Q9ERH8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc28a3Q9ERH8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc28a3Q9ERH8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc28a3Q9ERH8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc28a3Q9ERH8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc28a3Q9ERH8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc28a3Q9ERH8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc28a3Q9ERH8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc28a3Q9ERH8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc28a3Q9ERH8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc28a3Q9ERH8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc28a3Q9ERH8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc28a3Q9ERH8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc28a3Q9ERH8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc28a3Q9ERH8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc28a3Q9ERH8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc28a3Q9ERH8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc28a3Q9ERH8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc28a3Q9ERH8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc28a3Q9ERH8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc28a3Q9ERH8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc28a3Q9ERH8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc28a3Q9ERH8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc28a3Q9ERH8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc28a3Q9ERH8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc28a3Q9ERH8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc28a3Q9ERH8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc28a3Q9ERH8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc28a3Q9ERH8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc28a3Q9ERH8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc28a3Q9ERH8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc28a3Q9ERH8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc28a3Q9ERH8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc28a3Q9ERH8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms