Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG2

Strn3, Striatin-3, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn3Q9ERG2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Strn3Q9ERG2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Strn3Q9ERG2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Strn3Q9ERG2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Strn3Q9ERG2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Strn3Q9ERG2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Strn3Q9ERG2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Strn3Q9ERG2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Strn3Q9ERG2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Strn3Q9ERG2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Strn3Q9ERG2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Strn3Q9ERG2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Strn3Q9ERG2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Strn3Q9ERG2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Strn3Q9ERG2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Strn3Q9ERG2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Strn3Q9ERG2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Strn3Q9ERG2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Strn3Q9ERG2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Strn3Q9ERG2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Strn3Q9ERG2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Strn3Q9ERG2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Strn3Q9ERG2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Strn3Q9ERG2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Strn3Q9ERG2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Strn3Q9ERG2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Strn3Q9ERG2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Strn3Q9ERG2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Strn3Q9ERG2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Strn3Q9ERG2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Strn3Q9ERG2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Strn3Q9ERG2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Strn3Q9ERG2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Strn3Q9ERG2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Strn3Q9ERG2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strn3Q9ERG2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strn3Q9ERG2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms