Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tfip11Q9ERA6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tfip11Q9ERA6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Tfip11Q9ERA6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tfip11Q9ERA6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tfip11Q9ERA6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tfip11Q9ERA6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tfip11Q9ERA6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Tfip11Q9ERA6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tfip11Q9ERA6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tfip11Q9ERA6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tfip11Q9ERA6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tfip11Q9ERA6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tfip11Q9ERA6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tfip11Q9ERA6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tfip11Q9ERA6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tfip11Q9ERA6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Tfip11Q9ERA6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tfip11Q9ERA6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tfip11Q9ERA6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tfip11Q9ERA6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Tfip11Q9ERA6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Tfip11Q9ERA6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tfip11Q9ERA6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tfip11Q9ERA6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tfip11Q9ERA6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tfip11Q9ERA6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tfip11Q9ERA6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tfip11Q9ERA6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tfip11Q9ERA6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tfip11Q9ERA6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tfip11Q9ERA6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tfip11Q9ERA6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tfip11Q9ERA6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tfip11Q9ERA6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tfip11Q9ERA6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tfip11Q9ERA6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tfip11Q9ERA6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tfip11Q9ERA6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tfip11Q9ERA6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tfip11Q9ERA6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tfip11Q9ERA6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tfip11Q9ERA6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tfip11Q9ERA6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tfip11Q9ERA6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tfip11Q9ERA6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tfip11Q9ERA6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tfip11Q9ERA6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tfip11Q9ERA6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tfip11Q9ERA6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tfip11Q9ERA6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tfip11Q9ERA6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tfip11Q9ERA6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tfip11Q9ERA6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tfip11Q9ERA6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tfip11Q9ERA6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tfip11Q9ERA6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tfip11Q9ERA6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tfip11Q9ERA6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tfip11Q9ERA6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tfip11Q9ERA6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tfip11Q9ERA6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tfip11Q9ERA6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tfip11Q9ERA6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tfip11Q9ERA6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tfip11Q9ERA6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tfip11Q9ERA6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tfip11Q9ERA6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tfip11Q9ERA6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tfip11Q9ERA6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tfip11Q9ERA6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tfip11Q9ERA6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tfip11Q9ERA6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tfip11Q9ERA6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tfip11Q9ERA6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tfip11Q9ERA6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Tfip11Q9ERA6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tfip11Q9ERA6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tfip11Q9ERA6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tfip11Q9ERA6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tfip11Q9ERA6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tfip11Q9ERA6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tfip11Q9ERA6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tfip11Q9ERA6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tfip11Q9ERA6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tfip11Q9ERA6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tfip11Q9ERA6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tfip11Q9ERA6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tfip11Q9ERA6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tfip11Q9ERA6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tfip11Q9ERA6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tfip11Q9ERA6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tfip11Q9ERA6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tfip11Q9ERA6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tfip11Q9ERA6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tfip11Q9ERA6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tfip11Q9ERA6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tfip11Q9ERA6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tfip11Q9ERA6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tfip11Q9ERA6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms