Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Dap3Q9ER88 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dap3Q9ER88 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Dap3Q9ER88 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dap3Q9ER88 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms