Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Cpsf1Q9EPU4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cpsf1Q9EPU4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Cpsf1Q9EPU4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cpsf1Q9EPU4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cpsf1Q9EPU4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cpsf1Q9EPU4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Cpsf1Q9EPU4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cpsf1Q9EPU4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cpsf1Q9EPU4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cpsf1Q9EPU4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cpsf1Q9EPU4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cpsf1Q9EPU4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cpsf1Q9EPU4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cpsf1Q9EPU4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cpsf1Q9EPU4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Cpsf1Q9EPU4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cpsf1Q9EPU4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cpsf1Q9EPU4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Cpsf1Q9EPU4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cpsf1Q9EPU4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cpsf1Q9EPU4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cpsf1Q9EPU4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cpsf1Q9EPU4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Cpsf1Q9EPU4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cpsf1Q9EPU4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cpsf1Q9EPU4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cpsf1Q9EPU4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cpsf1Q9EPU4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cpsf1Q9EPU4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cpsf1Q9EPU4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Cpsf1Q9EPU4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cpsf1Q9EPU4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Cpsf1Q9EPU4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cpsf1Q9EPU4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cpsf1Q9EPU4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cpsf1Q9EPU4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cpsf1Q9EPU4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cpsf1Q9EPU4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cpsf1Q9EPU4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cpsf1Q9EPU4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cpsf1Q9EPU4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cpsf1Q9EPU4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cpsf1Q9EPU4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cpsf1Q9EPU4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cpsf1Q9EPU4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cpsf1Q9EPU4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cpsf1Q9EPU4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms