Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp13a1Q9EPE9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp13a1Q9EPE9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a1Q9EPE9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a1Q9EPE9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a1Q9EPE9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp13a1Q9EPE9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp13a1Q9EPE9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp13a1Q9EPE9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp13a1Q9EPE9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp13a1Q9EPE9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp13a1Q9EPE9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp13a1Q9EPE9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp13a1Q9EPE9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp13a1Q9EPE9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp13a1Q9EPE9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp13a1Q9EPE9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp13a1Q9EPE9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp13a1Q9EPE9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp13a1Q9EPE9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp13a1Q9EPE9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp13a1Q9EPE9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp13a1Q9EPE9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp13a1Q9EPE9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp13a1Q9EPE9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp13a1Q9EPE9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp13a1Q9EPE9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp13a1Q9EPE9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp13a1Q9EPE9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp13a1Q9EPE9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp13a1Q9EPE9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp13a1Q9EPE9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp13a1Q9EPE9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp13a1Q9EPE9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp13a1Q9EPE9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp13a1Q9EPE9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp13a1Q9EPE9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp13a1Q9EPE9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp13a1Q9EPE9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp13a1Q9EPE9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp13a1Q9EPE9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp13a1Q9EPE9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp13a1Q9EPE9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms