Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf6Q9DBU5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf6Q9DBU5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf6Q9DBU5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf6Q9DBU5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf6Q9DBU5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf6Q9DBU5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf6Q9DBU5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf6Q9DBU5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf6Q9DBU5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf6Q9DBU5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf6Q9DBU5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf6Q9DBU5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf6Q9DBU5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf6Q9DBU5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf6Q9DBU5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf6Q9DBU5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf6Q9DBU5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf6Q9DBU5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf6Q9DBU5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf6Q9DBU5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf6Q9DBU5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf6Q9DBU5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf6Q9DBU5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf6Q9DBU5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf6Q9DBU5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf6Q9DBU5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf6Q9DBU5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf6Q9DBU5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf6Q9DBU5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf6Q9DBU5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf6Q9DBU5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf6Q9DBU5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf6Q9DBU5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf6Q9DBU5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf6Q9DBU5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf6Q9DBU5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf6Q9DBU5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf6Q9DBU5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf6Q9DBU5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf6Q9DBU5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf6Q9DBU5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf6Q9DBU5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf6Q9DBU5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf6Q9DBU5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf6Q9DBU5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf6Q9DBU5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf6Q9DBU5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf6Q9DBU5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf6Q9DBU5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf6Q9DBU5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf6Q9DBU5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf6Q9DBU5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf6Q9DBU5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf6Q9DBU5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf6Q9DBU5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf6Q9DBU5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf6Q9DBU5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf6Q9DBU5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf6Q9DBU5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf6Q9DBU5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf6Q9DBU5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf6Q9DBU5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf6Q9DBU5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf6Q9DBU5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf6Q9DBU5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf6Q9DBU5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms