Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBN9

Ddx59, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX59, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx59Q9DBN9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx59Q9DBN9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx59Q9DBN9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx59Q9DBN9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx59Q9DBN9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx59Q9DBN9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx59Q9DBN9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx59Q9DBN9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx59Q9DBN9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx59Q9DBN9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx59Q9DBN9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx59Q9DBN9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx59Q9DBN9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx59Q9DBN9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ddx59Q9DBN9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx59Q9DBN9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx59Q9DBN9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx59Q9DBN9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx59Q9DBN9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx59Q9DBN9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx59Q9DBN9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx59Q9DBN9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx59Q9DBN9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx59Q9DBN9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx59Q9DBN9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx59Q9DBN9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx59Q9DBN9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx59Q9DBN9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx59Q9DBN9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx59Q9DBN9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx59Q9DBN9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx59Q9DBN9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx59Q9DBN9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx59Q9DBN9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx59Q9DBN9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx59Q9DBN9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx59Q9DBN9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx59Q9DBN9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx59Q9DBN9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx59Q9DBN9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx59Q9DBN9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx59Q9DBN9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx59Q9DBN9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx59Q9DBN9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx59Q9DBN9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx59Q9DBN9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx59Q9DBN9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx59Q9DBN9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx59Q9DBN9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx59Q9DBN9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx59Q9DBN9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx59Q9DBN9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx59Q9DBN9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms