Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrpraQ9DBG7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SrpraQ9DBG7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SrpraQ9DBG7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrpraQ9DBG7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrpraQ9DBG7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms