Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fundc1Q9DB70 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fundc1Q9DB70 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fundc1Q9DB70 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fundc1Q9DB70 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fundc1Q9DB70 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fundc1Q9DB70 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fundc1Q9DB70 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fundc1Q9DB70 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fundc1Q9DB70 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fundc1Q9DB70 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fundc1Q9DB70 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fundc1Q9DB70 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fundc1Q9DB70 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fundc1Q9DB70 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fundc1Q9DB70 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fundc1Q9DB70 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fundc1Q9DB70 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fundc1Q9DB70 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fundc1Q9DB70 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fundc1Q9DB70 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fundc1Q9DB70 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Fundc1Q9DB70 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fundc1Q9DB70 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fundc1Q9DB70 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fundc1Q9DB70 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fundc1Q9DB70 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fundc1Q9DB70 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fundc1Q9DB70 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fundc1Q9DB70 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fundc1Q9DB70 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Fundc1Q9DB70 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fundc1Q9DB70 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fundc1Q9DB70 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fundc1Q9DB70 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fundc1Q9DB70 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fundc1Q9DB70 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms