Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scp2d1Q9DAH1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scp2d1Q9DAH1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scp2d1Q9DAH1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scp2d1Q9DAH1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms