Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem239Q9DA47 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem239Q9DA47 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem239Q9DA47 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem239Q9DA47 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms