Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P2

Ccdc103, Coiled-coil domain-containing protein 103, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc103Q9D9P2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc103Q9D9P2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc103Q9D9P2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc103Q9D9P2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc103Q9D9P2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc103Q9D9P2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc103Q9D9P2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc103Q9D9P2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc103Q9D9P2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc103Q9D9P2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc103Q9D9P2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc103Q9D9P2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc103Q9D9P2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc103Q9D9P2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc103Q9D9P2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc103Q9D9P2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc103Q9D9P2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc103Q9D9P2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc103Q9D9P2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc103Q9D9P2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc103Q9D9P2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc103Q9D9P2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc103Q9D9P2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc103Q9D9P2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms