Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot8Q9D8X5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot8Q9D8X5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot8Q9D8X5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnot8Q9D8X5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnot8Q9D8X5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnot8Q9D8X5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnot8Q9D8X5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnot8Q9D8X5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot8Q9D8X5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot8Q9D8X5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot8Q9D8X5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot8Q9D8X5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot8Q9D8X5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot8Q9D8X5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot8Q9D8X5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot8Q9D8X5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot8Q9D8X5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cnot8Q9D8X5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cnot8Q9D8X5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnot8Q9D8X5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot8Q9D8X5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.6 ms