Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Alkbh4Q9D8F1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Alkbh4Q9D8F1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Alkbh4Q9D8F1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Alkbh4Q9D8F1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms