Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn9Q9D805 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Capn9Q9D805 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Capn9Q9D805 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn9Q9D805 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn9Q9D805 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms