Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Polr2dQ9D7M8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Polr2dQ9D7M8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Polr2dQ9D7M8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Polr2dQ9D7M8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Polr2dQ9D7M8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Polr2dQ9D7M8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Polr2dQ9D7M8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Polr2dQ9D7M8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr2dQ9D7M8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr2dQ9D7M8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr2dQ9D7M8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr2dQ9D7M8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Polr2dQ9D7M8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Polr2dQ9D7M8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Polr2dQ9D7M8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Polr2dQ9D7M8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr2dQ9D7M8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr2dQ9D7M8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr2dQ9D7M8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr2dQ9D7M8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr2dQ9D7M8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr2dQ9D7M8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Polr2dQ9D7M8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Polr2dQ9D7M8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Polr2dQ9D7M8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Polr2dQ9D7M8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Polr2dQ9D7M8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Polr2dQ9D7M8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Polr2dQ9D7M8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Polr2dQ9D7M8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr2dQ9D7M8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr2dQ9D7M8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr2dQ9D7M8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Polr2dQ9D7M8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr2dQ9D7M8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms