Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nsmce1Q9D720 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nsmce1Q9D720 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nsmce1Q9D720 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nsmce1Q9D720 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nsmce1Q9D720 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nsmce1Q9D720 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nsmce1Q9D720 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nsmce1Q9D720 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nsmce1Q9D720 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nsmce1Q9D720 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nsmce1Q9D720 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nsmce1Q9D720 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nsmce1Q9D720 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nsmce1Q9D720 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nsmce1Q9D720 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nsmce1Q9D720 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nsmce1Q9D720 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nsmce1Q9D720 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nsmce1Q9D720 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nsmce1Q9D720 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsmce1Q9D720 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Nsmce1Q9D720 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms