Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ccdc94Q9D6J3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc94Q9D6J3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc94Q9D6J3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc94Q9D6J3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc94Q9D6J3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc94Q9D6J3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc94Q9D6J3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc94Q9D6J3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc94Q9D6J3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc94Q9D6J3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms