Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubb4aQ9D6F9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb4aQ9D6F9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb4aQ9D6F9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tubb4aQ9D6F9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms