Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc81Q9D5W4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc81Q9D5W4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc81Q9D5W4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc81Q9D5W4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc81Q9D5W4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc81Q9D5W4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc81Q9D5W4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc81Q9D5W4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc81Q9D5W4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc81Q9D5W4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc81Q9D5W4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc81Q9D5W4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc81Q9D5W4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc81Q9D5W4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc81Q9D5W4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc81Q9D5W4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc81Q9D5W4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc81Q9D5W4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc81Q9D5W4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc81Q9D5W4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc81Q9D5W4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc81Q9D5W4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc81Q9D5W4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc81Q9D5W4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc81Q9D5W4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc81Q9D5W4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc81Q9D5W4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc81Q9D5W4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc81Q9D5W4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc81Q9D5W4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc81Q9D5W4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc81Q9D5W4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc81Q9D5W4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc81Q9D5W4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc81Q9D5W4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc81Q9D5W4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc81Q9D5W4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc81Q9D5W4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc81Q9D5W4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc81Q9D5W4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc81Q9D5W4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc81Q9D5W4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc81Q9D5W4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc81Q9D5W4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc81Q9D5W4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc81Q9D5W4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc81Q9D5W4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc81Q9D5W4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc81Q9D5W4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc81Q9D5W4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc81Q9D5W4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc81Q9D5W4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc81Q9D5W4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc81Q9D5W4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc81Q9D5W4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.1 ms