Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc83Q9D4V3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc83Q9D4V3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc83Q9D4V3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc83Q9D4V3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc83Q9D4V3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc83Q9D4V3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc83Q9D4V3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc83Q9D4V3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc83Q9D4V3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc83Q9D4V3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc83Q9D4V3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc83Q9D4V3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc83Q9D4V3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc83Q9D4V3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc83Q9D4V3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.5 ms