Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a4cQ9D3F6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ms4a4cQ9D3F6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ms4a4cQ9D3F6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms