Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim42Q9D2H5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim42Q9D2H5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim42Q9D2H5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim42Q9D2H5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.5 ms