Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pramef12Q9D2F1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pramef12Q9D2F1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pramef12Q9D2F1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Pramef12Q9D2F1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pramef12Q9D2F1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pramef12Q9D2F1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Pramef12Q9D2F1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pramef12Q9D2F1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pramef12Q9D2F1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pramef12Q9D2F1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pramef12Q9D2F1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pramef12Q9D2F1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pramef12Q9D2F1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pramef12Q9D2F1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pramef12Q9D2F1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pramef12Q9D2F1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pramef12Q9D2F1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pramef12Q9D2F1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms