Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NkapQ9D0F4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NkapQ9D0F4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NkapQ9D0F4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NkapQ9D0F4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NkapQ9D0F4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NkapQ9D0F4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NkapQ9D0F4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NkapQ9D0F4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NkapQ9D0F4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NkapQ9D0F4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NkapQ9D0F4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NkapQ9D0F4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NkapQ9D0F4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NkapQ9D0F4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NkapQ9D0F4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NkapQ9D0F4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NkapQ9D0F4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NkapQ9D0F4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NkapQ9D0F4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NkapQ9D0F4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NkapQ9D0F4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NkapQ9D0F4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NkapQ9D0F4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NkapQ9D0F4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NkapQ9D0F4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NkapQ9D0F4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NkapQ9D0F4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NkapQ9D0F4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NkapQ9D0F4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NkapQ9D0F4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NkapQ9D0F4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NkapQ9D0F4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NkapQ9D0F4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NkapQ9D0F4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NkapQ9D0F4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NkapQ9D0F4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NkapQ9D0F4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NkapQ9D0F4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NkapQ9D0F4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NkapQ9D0F4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NkapQ9D0F4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NkapQ9D0F4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NkapQ9D0F4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NkapQ9D0F4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NkapQ9D0F4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NkapQ9D0F4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NkapQ9D0F4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NkapQ9D0F4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NkapQ9D0F4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms