Protein–RNA interactions for Protein: Q9D099

Acer3, Alkaline ceramidase 3, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acer3Q9D099 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Acer3Q9D099 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acer3Q9D099 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acer3Q9D099 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acer3Q9D099 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acer3Q9D099 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms