Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mms19Q9D071 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mms19Q9D071 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mms19Q9D071 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mms19Q9D071 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mms19Q9D071 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mms19Q9D071 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms