Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc47Q9D024 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc47Q9D024 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc47Q9D024 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc47Q9D024 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc47Q9D024 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc47Q9D024 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc47Q9D024 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc47Q9D024 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc47Q9D024 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc47Q9D024 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc47Q9D024 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc47Q9D024 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc47Q9D024 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc47Q9D024 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc47Q9D024 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc47Q9D024 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc47Q9D024 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc47Q9D024 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc47Q9D024 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc47Q9D024 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc47Q9D024 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc47Q9D024 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc47Q9D024 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc47Q9D024 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc47Q9D024 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc47Q9D024 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc47Q9D024 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc47Q9D024 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc47Q9D024 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc47Q9D024 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc47Q9D024 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc47Q9D024 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc47Q9D024 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc47Q9D024 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc47Q9D024 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc47Q9D024 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc47Q9D024 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc47Q9D024 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc47Q9D024 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc47Q9D024 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc47Q9D024 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc47Q9D024 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms