Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Shmt2Q9CZN7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shmt2Q9CZN7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shmt2Q9CZN7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shmt2Q9CZN7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shmt2Q9CZN7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shmt2Q9CZN7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shmt2Q9CZN7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shmt2Q9CZN7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shmt2Q9CZN7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shmt2Q9CZN7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shmt2Q9CZN7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shmt2Q9CZN7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shmt2Q9CZN7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Shmt2Q9CZN7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Shmt2Q9CZN7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Shmt2Q9CZN7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Shmt2Q9CZN7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Shmt2Q9CZN7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Shmt2Q9CZN7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shmt2Q9CZN7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shmt2Q9CZN7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shmt2Q9CZN7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shmt2Q9CZN7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shmt2Q9CZN7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shmt2Q9CZN7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shmt2Q9CZN7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms