Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdhd3Q9CYW4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdhd3Q9CYW4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdhd3Q9CYW4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdhd3Q9CYW4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms