Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl11Q9CXW4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl11Q9CXW4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rpl11Q9CXW4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl11Q9CXW4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms