Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH3

3300002I08Rik, RIKEN cDNA 3300002I08, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3300002I08RikQ9CXH3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
3300002I08RikQ9CXH3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
3300002I08RikQ9CXH3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
3300002I08RikQ9CXH3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
3300002I08RikQ9CXH3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
3300002I08RikQ9CXH3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
3300002I08RikQ9CXH3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
3300002I08RikQ9CXH3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
3300002I08RikQ9CXH3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
3300002I08RikQ9CXH3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
3300002I08RikQ9CXH3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
3300002I08RikQ9CXH3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
3300002I08RikQ9CXH3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
3300002I08RikQ9CXH3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms