Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmed5Q9CXE7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed5Q9CXE7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmed5Q9CXE7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmed5Q9CXE7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmed5Q9CXE7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms